在氟塑料換熱器的設計中，需要確定所取介質的材質，以及殼程和管程取什么介質。選擇時應遵循的基本原則如下：

（1）盡量提高氟塑料換熱器兩側的傳熱系數，使傳熱面兩側的傳熱系數接近。

（2）對于有毒介質或氣體介質，氟塑料換熱器不應泄漏，應特別注意其密封，既可靠又方便簡單。氟塑料換熱器能否使用取決于具體情況。

（3）管殼側的決定應盡可能容易清洗、除垢、防腐蝕，便于維護和修理，以保證運行的可靠性。

（4）在運行溫度較高的換熱器中，應盡可能減少熱損失，在一些制冷裝置中，應盡可能減少冷損失。  

（5）如果氟塑料換熱器的介質是小流量、高粘度的流體，一般宜采用殼程，因為殼程Re大于100時會產生紊流。然而，這不是肯定的。如果流動阻力損失允許，通過將這種流體引入管中并采用多管側結構，可以獲得更高的表面傳熱系數。

（6）氟塑料換熱器的管殼因受熱不同而產生的熱應力應降低。從這個角度來看，下游流動優于逆流類型，因為下游流動的入口和出口端的溫度相對平均。與逆流式不同，冷熱流體的高溫段集中在一端，低溫段集中在另一端，由于兩端收縮不同，容易產生熱應力。

（7）氟塑料換熱器的設備材料應避免使用貴金屬，以降低成本